WOS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
https://hdl.handle.net/20.500.12587/4
WoS Indexed Publications Collection2024-03-29T07:37:54ZMorphological and Genetic Characteristics of Zerdava, A Native Turkish Dog Breed
https://hdl.handle.net/20.500.12587/14228
Morphological and Genetic Characteristics of Zerdava, A Native Turkish Dog Breed
Özbaşer, Fatma Tülin; Atasoy, Fatih; Erdoğan, Metin; Özkul, Banu Yüceer; Özarslan, Bora
Zerdava dogs are considered as one of the many native animal genetic resources of Turkey. However, the genetic characteristics of these dogs and detailed phenotypic studies related to them have not been reported yet. The aim of this study was to determine the morphological and genetic characteristics of Zerdava dogs. Blood samples (n = 100) were collected from Zerdava dogs. The morphological characteristics of these dogs were also taken. The mean live weights of Zerdava dogs were found to be 16.02±0.35 kg. The mean withers height, rump height and body length were measured as 48.20±0.21, 47.08±0.24 and 51.24±0.23 cm, respectively. According to the results of microsatellite markers, the mean FIS (inbreeding coefficient) value was documented as 0.0361±0.0003. Observed (Ho) and expected heterozygosity (He) values were found to be 0.708±0.091 and 0.694±0.077, respectively. In addition, the frequency of A018 (72%) and B001 (16%) haplotypes were high in Zerdava dogs. The mitochondrial DNA sequence results show that the majority of Zerdava dogs originate from two different maternal lines. According to the results, the phenotypic and genotypic variations of Zerdava dogs were low. Therefore, these results may suggest that Zerdava dogs may have been protected by local breeders and can be considered a separate breed.; Zerdava köpekleri Türkiye’de birçok yerli hayvan gen kaynaklarından biridir. Ancak, bu köpeklerin genetik ve ayrıntılı fenotipik özellikleri hakkında çalışmaya rastlanılmamaktadır. Bu araştırmanın amacı, Zerdava köpeklerinin morfolojik ve genetik özelliklerini belirlemektir. Zerdava köpeklerinden kan örnekleri (n = 100) alınmıştır. Köpeklere ait morfolojik özellikler de incelenmiştir. Zerdava köpeklerinin ortalama canlı ağırlığı 16.02±0.35 kg olarak bulunmuştur. Ortalama cidago, sağrı yüksekliği ve vücut uzunluğu sırasıyla 48.20±0.21, 47.08±0.24 ve 51.24±0.23 cm’dir. Mikrosatellit işaretleyicilerinin sonuçlarına göre, ortalama FIS (nispi katsayı) değeri 0.0361±0.0003. Gözlenen (Ho) ve beklenen heterozigot (He) değerleri sırasıyla 0.708±0.091 ve 0.694±0.077 olarak tespit edilmiştir. Buna ilave, Zerdava köpeklerinde A018 (%72) ve B001 (%16) haplotiplerinin görülme sıklığı yüksek bulunmuştur. Mitokondriyal DNA sekans sonuçları çoğu Zerdava köpeğinin iki farklı anne soyundan köken aldığını göstermektedir. Mevcut sonuçlara göre, Zerdava köpeklerinin fenotipik ve genotipik varyasyonları düşük olduğu belirlenmiş olup bu köpeklerin yerel yetiştiriciler tarafından korunmuş olabileceği düşünülmektedir.
2020-01-01T00:00:00ZMalzeme güvenilirlik analizinde Weibull alt yüzdeliklerinin alt güven sınırının küçük örneklemlerle tahmini
https://hdl.handle.net/20.500.12587/14201
Malzeme güvenilirlik analizinde Weibull alt yüzdeliklerinin alt güven sınırının küçük örneklemlerle tahmini
Yalçınkaya, Meryem; Birgören, Burak
Weibull dağılımı seramik ve kompozit malzemelerin kopma mukavemeti gibi mekanik özelliklerinin modellenmesinde yaygın şekilde kullanılır. Mekanik özelliklerin %95 güven düzeyinde 1. yüzdelik ve 10. yüzdelik alt güven sınırları, diğer adıyla A-Temel ve B-Temel malzeme özellikleri, güvenilirlik çalışmalarında erken arızaları anlama ve risk azaltma için önemlidir. Bu alt sınırlar, deneylerin yüksek maliyetleri nedeniyle genellikle küçük örneklemlerle, dolayısıyla düşük hassasiyet düzeyleriyle tahmin edilir. Bu nedenle literatürde daha iyi tahminler gerçekleştirmeyi amaçlayan birçok kesin ve yaklaşık alt sınır tahmin yöntemi önerilmiştir. Bu çalışmada kesin yöntemlerin MonteCarlo benzetimleriyle kapsamlı bir karşılaştırması yapılmıştır. Ayrıca, Weibull parametreleri için geliştirilen bazı yöntemler kesin alt sınır tahmininde kullanılabilir olmakla birlikte literatürde bu amaçla hiç kullanılmadığından bu karşılaştırma kapsamına alınmıştır. Çalışmada alt sınırlar, maksimum benzerlik, Menon yöntemi ve ağırlıklı/ağırlıksız en küçük kareler yöntemlerinin 25 farklı modeli (geliştirilmiş tahminleyiciler, değiştirilmiş eksenler gibi) ile tahmin edilmiş ve sonuçlar, ortalama yanlış kapsama olasılığı kriterine göre karşılaştırılmıştır. Benzetim sonuçlarına göre, hacmi 20’den küçük örneklemlerde maksimum benzerlik ile Faucher & Tyson ağırlık faktörlü en küçük kareler yöntemlerinin çok benzer performansa sahip olduğu, hacmi 20 ve daha büyük örneklemlerde ise maksimum benzerlik yönteminin her zaman daha iyi olduğu gözlemlenmiştir. Bununla birlikte, performans farklarının ihmal edilebilir olduğu durumlarda hesaplama kolaylığı açısından en küçük kareler yöntemlerinin daha pratik olduğu vurgulanmıştır.; Weibull distribution is widely used in the modeling of mechanical properties such as tensile strength of ceramic and composite materials. The 95% one-sided confidence lower bounds on the 1st and 10th Weibull percentiles, namely A-basis and B-basis material properties, are important in reliability studies for understanding early failures and reducing risks. These lower bounds are generally estimated by small samples due to the high costs of the experiments, hence the precision of estimation remain low. Therefore, in the literature, many exact and approximate interval estimation methods for Weibull percentiles have been proposed for achieving better performance. In this study, a comprehensive comparison of the exact methods with Monte-Carlo simulations has been made. In addition, some methods developed for Weibull parameters are also included in this comparison since they can be used for exact lower bound estimation but have never used for this purpose in the literature. In the study, the lower bounds have been estimated by the maximum likelihood method, the Menon method and 25 different models of weighted/ unweighted least squares methods (such as improved estimators, interchanged axes), and average false coverage probabilities are used for the comparison criterion. According to the simulation results, the maximum likelihood and the weighted least squares method with Faucher & Tyson weight factors have very similar performances for sample sizes less than 8; and the maximum likelihood method has always shown the best performance for sample sizes greater than or equal to 20. However, it is emphasized that linear regression methods are more practical in terms of ease of calculation when performance differences are negligible.
2020-01-01T00:00:00ZComparison of the effects of zinc-silver cream and Nigella sativa oil on wound healing and oxidative stress in the wound model in rats
https://hdl.handle.net/20.500.12587/14125
Comparison of the effects of zinc-silver cream and Nigella sativa oil on wound healing and oxidative stress in the wound model in rats
Kumandaş, Ali; Karslı, Birkan; Kürüm, Aytül; Çınar, Miyase; Elma, Ertuğrul
The present study was undertaken to evaluate of Nigella sativa oil (NSO) and zinc-silver cream in a rat model of wound healing by means of clinical appearance, histopathology, oxidative stress parameters, and biomechanical tests. The rats were divided into three groups, each having twenty animals. Group 1 served as a control having wound. Other two groups received either NS oil or zinc-silver cream in addition to the wound. The study was initiated after the animals rested for 2 weeks for acclimation. Blood samples were collected from 10 randomly selected animals from each group at days 0, 3, 7 and 14 for oxidative stress measurements. Differences among groups for blood lipid peroxidation and antioxidant values were determined with respect to biochemical oxidative stress results (P<0.01). Wound sites of 10 animals from each group were allocated for histopathological examinations, and those of the remaining 10 animals from each group were used in biomechanical testing. Histopathological examination revealed that epithelization occurred in all groups. Inflammatory response with an intensive vascularization was present in the samples of the silver group (P<0.01). Consequently, zinc-silver group has differed positively in terms of biochemical and biomechanical and histological aspects compared to other groups for wound healing and oxidative stress.; Bu çalışma, rat yara modelinde çörekotu yağı ve çinko gümüş kreminin klinik görünüm, histopatoloji, oksidatif stres parametreleri ve biyomekanik testlerle değerlendirilerek yara iyileşmesi üzerine etkilerinin karşılaştırılması amacıyla yapıldı. Çalışmada kullanılan ratlar, her bir grupta 20 hayvan bulunan üç gruba ayrıldı. Grup 1, kontrol grubu olarak belirlendi. Diğer iki gruba sırasıyla yara oluşturulduktan sonra çörekotu yağı ve çinko-gümüş krem uygulandı. Çalışma, hayvanların adaptasyonu için 2 hafta dinlendirilmesinden sonra başlatıldı. Oksidatif stres ölçümleri için 0, 3, 7 ve 14. günlerde her gruptan rastgele seçilen 10 hayvandan kan örnekleri alındı. Kan lipid peroksidasyonu ve antioksidan değerleri için gruplar arası farklılıklar biyokimyasal oksidatif stres sonuçlarına göre belirlendi (P<0.01). Her gruptan 10 hayvanın sırt kısmındaki yara bölgeleri histopatolojik inceleme için tahsis edildi. Kalan 10’ar hayvanın sırt derileri ise biyomekanik testler için kullanıldı. Histopatolojik inceleme tüm gruplarda epitelizasyonun olduğunu ortaya koydu. Çinko-gümüş grubunun örneklerinde yoğun damarlanma ile inflamatuar yanıt tespit edildi (P<0.01). Sonuç olarak, çinko-gümüş grubu, yara iyileşmesi ve oksidatif stres için diğer gruplara kıyasla, biyokimyasal, biyomekanik ve histolojik yönleri bakımından pozitif olarak farklılık gösterdi.
2020-01-01T00:00:00ZThe Correlation Between Anti-Müllerian Hormone Concentrations and Reproductive Parameters in Diffrent Age Groups in Purebred Arabian Mares
https://hdl.handle.net/20.500.12587/14124
The Correlation Between Anti-Müllerian Hormone Concentrations and Reproductive Parameters in Diffrent Age Groups in Purebred Arabian Mares
Korkmaz, Ömer; Emre, Birten; Polat, İbrahim Mert; Zonturlu, Abuzer Kafar; Yağcı, İlknur Pir; Pekcan, Mert; Gürler, Şükrü
The objectives of this study were to examine correlations of serum anti-Müllerian hormone (AMH) levels with age, ovarian function and fertility performance in purebred Arabian mares and to assess the potential use of AMH concentrations as a fertility indicator for the selection of breeder animals. For this purpose, thirty-six non-lactating purebred Arabian mares with no previous fertility problems constituted the material of the study. The animals were assigned to groups according to their age: Group I (aged 4-8 years), group II (9-18 years) and group III (19-25 years). Mean serum AMH concentrations were significantly higher (P<0.001) in group II (0.873±0.096 ng/mL) than in groups I (0.466±0.051 ng/mL) and III (0.347±0.068 ng/mL). Furthermore, serum AMH concentration was positively correlated with the daily increase in ovarian follicle diameter as well with mares with higher conception rates. It was also negatively correlated with anovulation and number of mating per conception. In summary, a strong relationship was found between peripheral AMH concentrations and fertility performance in purebred Arabian mares.; Bu çalışmanın amacı, safkan Arap kısraklarda serum anti-Müllerian hormon (AMH) seviyelerinin yaş, ovaryum fonksiyonları ve fertilite performansı ile korelasyonlarını incelemek ve AMH konsantrasyonlarının damızlık hayvan seçimi için fertilite göstergesi olarak potansiyel kullanımını değerlendirmektir. Bu amaçla çalışmanın materyalini herhangi bir fertilite problemi bulunmayan ve laktasyonda olmayan 36 Safkan Arap kısrak oluşturdu. Hayvanlar yaşlarına göre 3 gruba ayrıldı: Grup I (4-8 yaş), grup II (9-18 yaş) ve grup III (19- 25 yaş). Ortalama serum AMH konsantrasyonları, grup II’de (0.873±0.096 ng/mL) grup I (0.466±0.051 ng/mL) ve III’e (0.347±0.068 ng/mL) göre anlamlı derecede yüksek bulundu (P<0.001). Kısraklarda serum AMH konsantrasyonunun, günlük ovaryum folikül çap artışıyla ve gebelik oranları ile pozitif korelasyon gösterirken anovulasyon ve gebelik başına düşen aşım sayısı ile negatif korelasyon gösterdiği görüldü. Özetle, safkan Arap kısraklarda periferik AMH konsantrasyonları ile fertilite performansı arasında güçlü bir ilişki tespit edildi.
2020-01-01T00:00:00Z