Protein ikincil yapi tahmini için yapay sinir ağı modellerinin optimizasyonu

Abstract

Bu çalışmada protein işlevlerinin anlaşılmasında hayati önemi olan ikincil yapılarının tahmin edilebilmesi için çok katmanlı yapay sinir ağı ve çift yönlü tekrarlayan yapay sinir ağı optimizasyonu yapılmıştır. Bazı optimizasyon işlemleri için özgür yazılımlar kullanılarak bir hesaplama kümesi hazırlanmıştır. Optimizasyon sonucunda çift yönlü tekrarlayan yapay sinir ağlarının çok katmanlı yapay sinir ağından daha başarılı sonuç verdiği görülmüştür.

In this study, a multi-layer artificial neural network and bidirectional recurrent artificial neural network optimization were performed in order to estimate secondary structures that are vital for understanding protein functions. For some optimization operations, a computation grid is prepared using open source software. As a result of the optimization, it has been seen that bidirectional artificial neural networks are more successful than the multi-layer artificial neural network.