Yazar "Elibol, Zeynep" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim
    Öğe
    Differential effects of nitrogen and sulfur deprivation on growth and biodiesel feedstock production of Chlamydomonas reinhardtii
    (Wiley-Blackwell, 2012) Çakmak, Turgay; Angun, Pınar; Demiray, Yunus Emre; Özkan, Alper Devrim; Elibol, Zeynep; Tekinay, Turgay
    Biodiesel production from microalgae is a promising approach for energy production; however, high cost of its process limits the use of microalgal biodiesel. Increasing the levels of triacylglycerol (TAG) levels, which is used as a biodiesel feedstock, in microalgae has been achieved mainly by nitrogen starvation. In this study, we compared effects of sulfur (S) and nitrogen (N) starvation on TAG accumulation and related parameters in wild-type Chlamydomonas reinhardtii CC-124 mt(-) and CC-125 mt(+) strains. Cell division was interrupted, protein and chlorophyll levels rapidly declined while cell volume, total neutral lipid, carotenoid, and carbohydrate content increased in response to nutrient starvation. Cytosolic lipid droplets in microalgae under nutrient starvation were monitored by three-dimensional confocal laser imaging of live cells. Infrared spectroscopy results showed that relative TAG, oligosaccharide and polysaccharide levels increased rapidly in response to nutrient starvation, especially S starvation. Both strains exhibited similar levels of regulation responses under mineral deficiency, however, the degree of their responses were significantly different, which emphasizes the importance of mating type on the physiological response of algae. Neutral lipid, TAG, and carbohydrate levels reached their peak values following 4 days of N or S starvation. Therefore, 4 days of N or S starvation provides an excellent way of increasing TAG content. Although increase in these parameters was followed by a subsequent decline in N-starved strains after 4 days, this decline was not observed in S-starved ones, which shows that S starvation is a better way of increasing TAG production of C. reinhardtii than N starvation. Biotechnol. Bioeng. 2012; 109:19471957. (c) 2012 Wiley Periodicals, Inc.
  • Küçük Resim
    Öğe
    A molecular phylogenetic study on some Turkish Ferula L. (Apiaceae) species using nrDNA its sequences
    (Pakistan Botanical Soc, 2012) Elibol, Zeynep; Menemen, Yusuf; Sagiroglu, Mehmet; Duman, Hayri
    nrDNA ITS sequence variation of Ferula species were studied by comparing with the other species of Ferula, Leutea and Dorema to clarify relationships amongst the taxa and infrageneric delimitation of the genus Ferula. In total, 35 nrDNA ITS sequence accessions (34 species) of Ferula, Leutea and Dorema were included in the analyses. 10 of these accessions were newly sequenced and belonged to Turkish species. Possible phylogenetic relationships amongst the species were determined using Maximum parsimony and neighbour joining tree methods. The analyses showed that the genus might be monophyletic upon the addition of Leutea and Dorema, but did not support the classification of the genus dividing into the subgenera.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Türkiye'deki bazı Ferula L. (Apiaceae) türlerinin moleküler teknikler kullanarak taksonomik olarak incelenmesi
    (Kırıkkale Üniversitesi, 2009) Elibol, Zeynep; Menemen, Yusuf
    Bu çalışmada, Ferula cinsine ait bazı türlerde tohumların endospermlerinden elde edilen nrDNA ITS bölgeleri PCR yardımıyla çoğaltıldı; ürünlerin dizi analizi yapılarak türler arasındaki genetik benzerlik ve farklılıklar ortaya konularak aralarındaki akrabalık ilişkileri taksonomik olarak araştırıldı.nrDNA ITS çalışmalarında kullanılmak üzere bazı Ferula türlerinin sağlam ve olgun tohumlarından genomik DNA izolasyonu bir tür (Ferula szowitsiana) hariç ilk defa gerçekleştirildi. Taksonların ITS bölgeleri evrensel ITS primerleri kullanılarak PCR yoluyla çoğaltıldı. Örnekler arasında, ITS bölge uzunluğunun 692 ile 700 bç arasında değiştiği tespit edildi. Elde edilen ITS dizileri ClustalW programı yardımıyla, analiz işlemlerinde kullanılmak üzere hizalandı. Tüm örneklere ait ITS baz dizileri PAUP 4.0b.10 programı kullanılarak analiz edildi ve çalışılan Ferula türleri arasındaki akrabalık ilişkilerini gösteren hem parsimoni hem de komşu bağlantı ağacı oluşturuldu.Moleküler verilerden elde edilen sonuçlar morfolojik karakterlere dayalı sınıflandırma ile karşılaştırılmış ve çalışılan taksonlar arasındaki ilişkiler ortaya konulmaya çalışılmıştır.Bu çalışmadan elde edilen moleküler veriler ile yapılan parsimoni analizi ve komşu bağlantı analizi ağacı bu cinsin altcins ve seksiyonlar seviyesinde ayrılarak sınıflandırılmasını desteklemiştir. Ayrıca bu çalışma cinsin monofiletik olmayıp, polifiletik olabileceği hususunda ipuçları vermiştir.