Yazar "Diker, Kadir Serdar" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim
    Öğe
    Base study for the establishment of national Salmonella control program in hatching farms and table eggs in Turkey
    (Scientific Technical Research Council Turkey-Tubitak, 2020) Diker, Kadir Serdar; Goncuoglu, Muammer; Sahin, Guzin; Akan, Mehmet; Gurcan, Ismail Safa; Mustak, Hamit Kaan
    Foodborne infections due to Salmonella are still a major concern worldwide. Particularly contaminated egg and egg related products are the primary sources for human salmonellosis. It is necessary to determine the risk factors associated with Salmonella contamination of eggs within the scope of farm to table and environment. The objective of this study was to develop the "National Salmonella Control Program in Laying Hens" and report the prevalence and serotype distribution findings of Salmonella in laying hens and eggs in Turkey. A total of 2122 samples were collected and analysed according to ISO 6579:2002 after the isolation and identification procedures. All Salmonella isolates were serotyped including 726 eggs and 1396 farm specimens from 241 epidemiological units (EpUs) that were located in 9 different provinces between 2015 and 2017. Salmonella contamination was detected in 14.9% of 241 EpUs. The results indicated that almost half of the flocks have multiple contamination sources. The highest contamination rate was obtained from environmental (11%) followed by faeces (7.5%) and the lowest was from water samples (1.6%). The overall contamination rate was detected as 7.46% for farms and 3.3% for eggs. As S. Enteritidis and S. Typhimurium are the most frequently seen serotypes all over the world, in Turkey S. Typhimurium was not detected and S. Enteritidis was the 5th most common isolated serotype. According to our results it can be concluded that differences in various countries, particularly geographical and egg hatching systems, may affect the contamination rate and serotype distribution of Salmonella.
  • [ X ]
    Öğe
    Epidemiological investigation of bovine tuberculosis infection dynamics in Turkey
    (Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2022) Cakir, Sahin; Yildirim, Murat; Diker, Kadir Serdar; Keskin, Fevziye Ipek; Yuksel, Selcen; Deveci, Burak; Akcay, Erhan
    A national epidemiological research project was carried out to define the dynamics affecting the epidemiology of bovine tuberculosis (bTB) infection in Turkey and to identify the risk factors. Official veterinarian (OV) and breeder original questionnaires were produced separately as part of this study to collect thorough data regarding the disease from the field. The number of questionnaires that needed to be filled out was decided by 95% confidence interval (CI) and 5% margin of error. The findings of 371 OV and 317 breeder questionnaires completed online across the country were analyzed. In addition, 28 outbreaks determined by random method were visited. To observe regional differences and field conditions, the opinions of OVs who monitored the disease and breeders were compiled. It was observed that the data obtained from both questionnaires was largely compatible. The main factors in the epidemiology of bTB infection were found to be effective fight, development of state policy, providing adequate financing, animal purchase, ear tagging and records, animal traders, animal markets, animal movements, conditional slaughtering, slaughterhouses, postmortem inspection, premise conditions, socio-economic impact, evaluation of raw milk, disease-free premises, compensation payments, and quarantine processes.
  • [ X ]
    Öğe
    Kanatlı Hayvanlardan ve Gıdalardan Salmonella İzlenmesi ve Kontrol Programlarının Geliştirilmesi
    (2017) Diker, Kadir Serdar; Türkyılmaz, Özhan; Alper, Neslihan; Ayaz, Naim Deniz; Yılmaz, Semra; Akan, Mehmet; Güncüoğlu, Muammer
    Türkiye’deki kanatlı üretim zincirinde Salmonella sıklığını azaltmaya yönelik bir ulusal kontrol programı için çalışmalar yapıldı. Kanatlılara ait 9295 materyalin incelenmesi ile broyler, yumurtacı, hindi ve damızlık epidemiyolojik birimlerindeki Salmonella oranı sırasıyla %24,5, %7,4, %21,5 ve %4,2 olarak bulundu. Kanatlı kesimhane ve gıdalarına ait 3017 materyalin %39,3 ve %24,3’ünde Salmonella kontaminasyonu bulundu. İncelenen 29 ildeki oranlar 2.9 ile %70,6 arasında değişti. Kanatlılarda toplam 33 serotip bulundu. Broyler, hindi, damızlık, kesimhane ve gıda örneklerindeki baskın serotip S.Infantis iken, yumurtacılarda S.Kentucky oldu. Ribotiplendirme ve PFGE bulguları broyler suşlarının küçük coğrafik alanlarda kümelendiğini, bu da sınırlı bir klonal yayılmanın olduğunu gösterdi. Salmonella izolatlarının 10 antimikrobiyal maddeye dirençlilikleri arasında, özellikle yumurtacılarda ve S.Kentucky’de daha fazla olmak üzere farklılıklar bulundu. Direnç genleri ve mekanizmaları moleküler yöntemlerle daha ileri düzeyde analiz edildi. Çoklu antibiyotik dirençli suşların sıklığında serotip ve üretim tipine göre farklılıklar belirlendi. Ticari moleküler kitlerin ve bu çalışmada geliştirilen LAMP PCR’ın tanı performansı altın standart olan ISO6579’a yakın bulundu. Kanatlı orijinli kaynaklardan elde edilen bakteriyofajlar kontamine edilmiş materyaldeki belirli serotipler üzerinde orta-ileri düzeyde aktivite gösterdi. S.Infantis aşı suşu, klonal tipe ilaveten virulens ve kolonizasyon ilişkili genlerin varlığına göre seçildi ve bir aroA mutantı oluşturuldu. Epidemiyolojik bulgulara ve rutin prosedürlerin Salmonella kontrolündeki rollerini araştıran saha çalışmalarının sonuçlarına göre bir kontrol programı oluşturuldu. Kontrol programı, kanatlılarda Salmonella kontrolü için, dezenfeksiyon protokolünün, çevresel kontaminasyonun önlenmesinin, optimal üretim arası uzunluğunun ve diğer konulardaki uygulamaların önemini vurguladı. Son olarak toplanan verileri işlemek ve sürdürülebilirliğini sağlamak için SALKON adlı web tabanlı veritabanı oluşturuldu.