Yazar "Kutluer, Fatih" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 11 / 11
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Antifungal activities of Fomitopsis pinicola (Sw.:Fr) Karst and Lactarius vellereus (Pers.) Fr.(Academic Journals, 2009) Güler, Perihan; Akata, Ilgaz; Kutluer, FatihIn this study, antifungal activities of Fomitopsis pinicola (Sw.:Fr) Karst and Lactarius vellereus (Pers.) Fr. extracts with chloroform and ethanol against Fusarium inflexum and Fusarium heterosporium were investigated. Mycelial discs (8 mm empty set) taken from actively growing margin of 7-day-old culture of each species and were placed in each extract medium. All species were incubated for 3 days at 28 degrees C in the dark. Antifungal activity was obtained by disc diffusion method.Öğe Antifungal effects of Clitocybe odora (Bull.: Fr.) kumm. against the plant pathogen Fusarium culmorum and Fusarium moniliforme(2011) Türkoğlu, Aziz; Güler, Perihan; Araz, Aydan; Kutluer, Fatih; Kunduz, İlknurBu çalışmada, Clitocybe odora aseptik şartlarda kurutuldu ve 12 saat süre ile çözgenler içinde bırakıldı. Ekstraktlar süzüldü ve evaporatör kullanarak 600C’de kurutuldu. Elde edilen kuru materyaller 40C’de muhafaza edildi. Antifungal aktiviteler Disk Difüzyon metodu ile ölçüldü. Bu metoda göre, F.culmorum ve F.moniliforme inokulumları patates dekstroz agar besiyeri üzerine yayıldı. Clitocybe odora ekstraktları 6 mm çapındaki disklerde 10 ?l olacak şekilde emdirildi. Tüm diskler besiyeri üzerine ayrı ayrı bırakıldı ve 280C’de 48 saat inkübe edildi. Kontrol için su ve sadece aseton ve kloroform içeren diskler kullanıldı. Çalışmada ticari antibiyotikler eritromisin ve amoksilin karşılaştırma için kullanıldı.Öğe Deep neural network and molecular docking supported toxicity profile of prometryn(Elsevier Ltd, 2023) Çakir, Feride; Kutluer, Fatih; Yalçin, Emine; Çavuşoğlu, Kültiğin; Acar, AliIn this study, the versatile toxicity profile of prometryn herbicide on Allium cepa was investigated. In this context, 4 different groups were formed. While the control group was treated with distilled water, Groups II, III and IV were treated with 200 mg/L, 400 mg/L and 800 mg/L prometryn, respectively. After 72 h of germination, cytogenetic, biochemical, physiological and anatomical changes were investigated. As a result increase in malondialdehyde levels, decrease in glutathione level, changes in superoxide dismutase and catalase activities in root tip cells show that prometryn causes oxidative stress. The decrease in mitotic index values and the increase in the frequency of micronucleus and chromosomal abnormalities observed after prometryn treatment indicate genotoxic effects. The genotoxic effects may be due to the induced oxidative stress as well as the promethryn-DNA interaction. Molecular docking analyses revealed that prometryn interacts with various bases in DNA. As a result of the Comet assay, exposure to prometryn was found to cause DNA fragmentation. In physiological parameters final weight, germination percentage and root length decreased by 23.8%, 59.1% and 87.3%, respectively, in the 800 mg/L prometryn applied group. Deep neural network (DNN) model was optimized to predict the effects of different doses of prometryn on 4 different endpoints: micronucleus, mitotic index, chromosomal abnormalities and DNA Damage. The predicted data was found to be very similar to the actual data. The performance of the model was evaluated using MAE, MAPE, RMSE and R2, and these metrics indicate that the model performed well. Overall, the findings of this study suggest that the DNN model developed here is a valuable tool for predicting genotoxicity biomarkers in response to the application doses of prometryn, and has the potential to contribute to the development of safer and more sustainable agricultural practices. © 2023 Elsevier LtdÖğe Deltametrin'in Allium cepa L.'daki Fizyolojik, Anatomik ve Genotoksik Etkilerinin Araştırılması(2019) Kutluer, Fatih; Çavuşoğlu, Kültiğin; Yalçın, EmineBu çalışmanın amacı, Allium cepa L.’da deltametrinin toksik etkilerini araştırmaktır. Bu amaçla, kök uzunluğu, ağırlık kazanımı, çimlenme yüzdesi, mikronukleus (MN), kromozomal anormallik sıklığı ve anatomik değişimler ile malondialdehit (MDA) düzeyi gibi parametreler kullanılmıştır. Bulblar 1 kontrol ve 3 uygulama olarak 4 gruba ayrılmıştır. Kontrol grubu bulblar çeşme suyu, uygulama grubu bulblar ise deltametrinin 5, 10 ve 20 mg L - 1 dozları ile 72 saat muamele edilmiştir. Sonuçlar, kontrol grubu ile karşılaştırıldığında, tüm uygulama gruplarında, kök uzunluğunu, ağırlık kazanımı ve çimlenme yüzdesinin azaldığını, MN ve kromozomal anormalliklerin sayısının ise arttığını göstermiştir. Yapışkan kromozom, köprü, fragment, c-mitoz ve kromatinin eşit olmayan dağılımı şeklinde kromozomal anormallikler gözlenmiştir. Ayrıca, sonuçlar, deltametrinin uygulanan tüm dozlarda yassılaşmış hücre çekirdeği, nekroz, iletim dokuda bazı maddelerin birikimi, korteks hücre duvarında kalınlaşma, belirgin olmayan iletim doku ve hücre deformasyonu vb. anatomik hasarlara neden olduğunu da göstermiştir. Diğer yandan, deltametrine maruz kalan kök uçlarının MDA düzeylerinde önemli bir değişim olduğu saptanmıştır. Deltametrin uygulamasının lipid peroksidasyonunu önemli ölçüde arttırdığı ve tüm uygulama gruplarında MDA düzeylerinde bir artışa neden olduğu belirlenmiştir. Bu çalışmada elde edilen veriler, A. cepa biyo-analizlerinin deltametrin’in muhtemel toksisitesini belirlemede önemli bir indikatör olarak kullanılabileceğini göstermiştir.Öğe Direct and indirect toxicity mechanisms of the natural insecticide azadirachtin based on in-silico interactions with tubulin, topoisomerase and DNA(Elsevier Ltd, 2024) Kutluer, Fatih; Özkan, Burak; Yalçin, Emine; Çavuşoğlu, KültiğinNatural pesticides, which attract attention with safe properties, pose a threat to many non-target organisms, so their toxic effects should be studied extensively. In this study, the toxic effects of Azadirachtin, a natural insecticide derived from Azadirachta indica, were investigated by in-vivo and in-silico methods. In-vivo toxic effects were determined using the Allium test and bulbs were treated with 5 mg/L (0.5x EC50), 10 mg/L (EC50), and 20 mg/L (2xEC50) Azadirachtin. In the groups treated with Azadirachtin, there was a decline in germination-related parameters and accordingly growth was delayed. This regression may be related to oxidative stress in the plant, and the increase in malondialdehyde and proline levels in Azadirachtin-applied groups confirms oxidative stress. Azadirachtin toxicity increased dose-dependently and the most significant toxic effect was observed in the group administered 20 mg/L Azadirachtin. In this group, the mitotic index decreased by 43.4% and sticky chromosomes, vagrant chromosomes and fragments were detected at rates of 83.1 ± 4.01, 72.7 ± 3.46 and 65.1 ± 3.51, respectively. By comet analysis, it was determined that Azadirachtin caused DNA fragmentation, and tail DNA, which was 0.10 ± 0.32% in the control group, increased to 34.5 ± 1.35% in the Azadirachtin -treated groups. These cytotoxic and genotoxic effects of Azadirachtin may be due to direct interaction with macromolecules as well as induced oxidative stress. Azadirachtin has been found to interact in-silico with alpha-tubulin, beta-tubulin, topoisomerase I and II, and various DNA sequences. Possible deteriorations in macromolecular structure and functions as a result of these interactions may cause cytotoxic and genotoxic effects. These results suggest that natural insecticides may also be unreliable for non-target organisms, and the toxic effects of compounds presented as “natural” should also be investigated. © 2024 Elsevier LtdÖğe Effect of formaldehyde exposure on phytochemical content and functional activity of Agaricus bisporus (Lge.) Sing.(Springer, 2024) Kutluer, FatihIn this study, the effect of formaldehyde on phytochemical content and antioxidant activity of Agaricus bisporus was investigated. Synthetic compost based on wheat straw was prepared by fermentation and disinfection. After steam pasteurization, 5 g of A. bisporus mycelia were inoculated into 1 kg of compost. To determine the effects of formaldehyde, 2, 4, and 6% concentrations were added to the composts, while compost without formaldehyde was used for the control group. The harvesting period was set at 10 weeks. Total phenolic and flavonoid content, macro- and microelement profile, and phenolic content were analyzed in the harvested A. bisporus samples. Macro- and microelement content was determined by ICP-OES, and phenolic compound profile was determined by LC-MS/MS analysis. Formaldehyde levels in A. bisporus samples were determined by the acetylacetone spectrophotometry method. The antioxidant capacity of A. bisporus samples was determined by DPPH scavenging activity; antimutagenic effects of samples were determined by Allium test. Application of 2, 4, and 6% formaldehyde resulted in a 1.12-, 1.19-, and 2.07-fold reduction in total phenolic content, respectively. The total phenolic content was reduced between 34.4% and 71.8%. These changes were confirmed by LC-MS/MS analysis. Compounds such as protocatechuic acid, salicylic acid, ferulic acid, and 4-OH benzoic acid, which were detected in the control group, could not be detected in the samples treated with 6% formaldehyde, and it was found that the application of formaldehyde reduced the phenolic content. Similar changes were also observed in macro- and microelements, and significant changes in elemental contents were observed after formaldehyde application. While the presence of formaldehyde at a low level, which may be due to natural production, was detected in the control group, a residue of 11.41 ± 0.93 mg/kg was determined in the 6% FMD applied group. All these changes resulted in a decrease in the antioxidant activity of A. bisporus. The DPPH scavenging activity, which was determined in the range of 21.6–73.3% in the control samples, decreased to 12.3–56.7% in the samples treated with formaldehyde. These results indicate that the application of formaldehyde at different stages of A. bisporus cultivation leads to significant changes in the nutritional value and biological activity of A. bisporus. © The Author(s) 2024.Öğe Formaldehit’in Agaricus bisporus’ daki Etkilerinin İncelenmesi(Kırıkkale Üniversitesi, 2024) Kutluer, FatihBu çalışmanın amacı, Formaldehit’in Agaricus bisporus’ daki etkilerinin incelenmesidir. Bu amaçla misel gelişimi, vitamin değerleri, mineral değerleri ve toksik madde birikimi gibi parametreler kullanılmıştır. 1 kontrol grubu ve 3 uygulama olarak 4 farklı gruba ayrılmıştır. Laboratuvarımızda ürettiğimiz Agaricus bisporus’dan alınan spor örnekleri kullanılmıştır. Kontrol grubunda Agaricus bisporus Sabouraud Dextrose Agar besiyerinde çimlendirilmiş, uygulama gruplarında ise sırasıyla Sabouraud Dextrose Agar %2.5, %5 ve %10 Formaldehit uygulaması ile 10 gün boyunca çimlendirilmiştir. Sonuçlar kontrol grubu ile karşılaştırıldığında misel gelişiminin kontrol grubuna oranla verilen dozlara paralel olarak azaldığı, vitamin değerlerinin azaldığı ve toksik madde birikiminin arttığı tespit edilmiştir. Bu çalışmada elde edilen veriler Agaricus bisporus üretiminde Formaldehit kullanımının sınırlandırılması gerektiğini açıkça ortaya konulmuşturÖğe Investigation of the Effects of Kombucha Mushroom on Mycelium Growth of Agaricus bisporus Using Artificial Neural Networks(2024) Kutluer, Fatih; Güngüneş, RamazanThe effects of Kombu mushroom extract on Agaricus bisporus mycelia development were the subject of this study. To prepare kombu mushroom extract; 60 g of sugar and black tea were added to 1 liter of water and fermentation of Kombu mushroom was achieved in this environment. The obtained extract was added to the potato dextrose agar medium at 0, 50, 75, 100cc. Mycelial agar discs of Agaricus bisporus with prepared agar were inoculated, developed at 23°C for 10 days, and mycelial development was examined. At the end of the incubation period, it was observed that mycelial development in the groups to which Kombucha mushroom extract was added was much better than the control group.Öğe Kombucha Ekstraktının Agarıcus bisporus ve Pleurotus ostreatus Misel Gelişimlerine Etkileri(Kırıkkale Üniversitesi, 2023) Kutluer, FatihBu çalışmada kombucha mantar ekstraktının Agaricus bisporus ve Pleurotus ostreatus misel gelişimlerine etkileri incelenmiştir. Kombucha mantarı genellikle siyah çayı fermente etmektedir. Maya ve asetik asit bakterilerinin simbiyotik birleşimleri neticesinde oluşmuştur. Manchurian mantarı olarak ta adlandırılır. Kombucha Mantar ekstraktının Agarıcus bısporus ve Pleurotus ostreatus misel gelişimlerine etkisi bu çalışmanın konusunu oluşturmuştur. Kombu mantarının ekstraktının elde edilmesi için 1 lt suya 60 gr şeker ve siyah çay ilave edilmiş 14 gün direk güneş ışığı almayacak şekilde fermantasyonu sağlanmıştır. Fermantasyon işlemi sonrasında elde edilen ekstrakt 50cc, 75cc,100cc ve kontrol grubu olmak üzere 4 ayrı gruba ayrılmıştır. Bu gruplar daha sonra Patetes dektroz agar besiyerine ilave edilmiştir. Hazırlanan besiyerlerine Agarıcus bısporus ve Pleurotus ostreatus miselyal agar diskleri inoküle edilmiştir. 10 gün boyunca zon çapları ölçülerek miselyal gelişimleri izlenmiştir. Kontrol grubu ve ekstre ilave edilen besiyerlerinin tamamında misel gelişmesi gözlemlenmiştir.10 günlük inkübasyon sonrasında kontrol grubuna oranla kombu ekstraktı ilave edilen besiyerlerinde gelişimlerin daha iyi tespit edilmiştirÖğe Kombucha mantarının kültürel özellikleri ve şeker redüksiyonunun incelenmesi(Kırıkkale Üniversitesi, 2009) Kutluer, Fatih; Güler, PerihanKombucha ya da Kombu mantarı olarak bilinen Manchurian mantarı genellikle siyah çayı fermente etmekte ve bu nedenle çay mantarı olarak ta anılmaktadır. Kombucha mantarı tipik olarak asetik asit bakterileri ve mayalar ile simbiyotik kültür oluşturmaktadır.Bu çalışmada ülkemizde çok fazla tanınmayan Kombucha mantarının glikoz, fruktoz, sükroz, dekstroz, maltoz ve laktozu redükte ederek kullanması ve şeker ilave edilerek hazırlanan ortamların pH değişimleri incelenmiştir.Değişik konsantrasyonlardaki farklı karbonhidratların ilavesi ile hazırlanan ortamlarda geliştirilen Kombu mantarının anatomik yapıları ışık ve Scanning Elektron Mikroskobunda (SEM) incelenmiştir. Kombu mantarının içerdiği elementler her ortamda ayrı ayrı SEM ile tespit edilerek grafiklendirilmiştir.Öğe Screening to mycelium specifications of ganoderma lucidum (Fr.) karst (reishi)(2011) Güler, Perihan; Kutluer, Fatih; Kunduz, İlknurBu çalışmada, ölümsüzlük mantarı olarak bilinen Ganoderma lucidum-Reishi’un morfolojik ve anatomik yapısı incelendi. G. lucidum doku parçası patates dekstroz agar merkezine ekildi ve 28ºC’de 22 günlük bir süre için karanlık olarak inkübe edildi. Aşılama döneminin sonunda; misel beyaz renkli ve çok sağlam bir doku oluştu. G. lucidum’un spor ve misellerinin anatomik çalışmaları elektron mikroskobu (SEM) ve ışık mikroskobu (LM) ile ayrı ayrı tespit edildi ve fotoğrafları çekildi.
