Genç çiftlik hayvanlarının ishal vakalarından, clostridium difficile'in izolasyonu, identifikasyonu ve antimikrobiyal duyarlılığının belirlenmesi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorYıldırım, Murat
dc.contributor.authorÖzgen, Ediz Kağan
dc.date.accessioned2021-01-16T19:03:51Z
dc.date.available2021-01-16T19:03:51Z
dc.date.issued2018
dc.departmentKKÜ, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Anabilim Dalı
dc.description.abstractClostridium difficile (Bacillus difficile) ilk olarak 1935 yılında bebek gaita örneklerinden izole edilmiş ve patojen olduğu düşünülmemiştir. Ancak 1978 yılından itibaren antibiyotik ilişkili diyare ve psödomembranöz kolitise neden olduğu ortaya konularak patojen olarak kabul edilmiştir. Bu çalışma ile ishalli buzağı, kuzu, oğlak ve işletme içinde yetiştirilen tavuklarda C. difficile'nin tespit edilmesi, bu izolatların toksijenik olarak karakterize edilmesi, toksin üretebilen izolatların PCR ribotiplendirmelerinin yapılması ve mikrobroth dilüsyon metodu ile antimikrobiyal duyarlılıklarının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışma kapsamında 2015 yılında neonatal dönemdeki ishalli 50 adet buzağı, 50 adet kuzu ve 50 adet oğlak gaita örnekleri numunesi ile 50 adet tavuk kloakal svap örneği olmak üzere toplam 200 adet gaita örneği alınarak incelendi. Araştırma boyunca toplanan gaita örneklerinin 58 (% 29.0)'inden Clostridium difficile izole edildi. Buzağılardan alınan gaita örneklerinin 35 (% 70.0)'inden, kuzu örneklerinin 15 (% 30.0)'inden, oğlak numunelerinin 7 (% 14.0)'ünden ve tavuk gaita örneklerinin 1 (% 2.0)'sinden Clostridium difficile tespit edildi. Tür identifikasyonu ve toksin karakterizasyonu ile izolatların 28 (% 48.2)'inin toksijenik karaktere sahip olduğu belirlendi. Toksijenik olan 28 izolatın PCR ribotiplendirmesinde 078, 012 ve 033 ribotipleri tespit edildi. Toplam 24 adet toksijenik suşun mikrobroth dilüsyon metodu ile antimikrobiyal duyarlılık testleri yapıldı. Toksijenik olan izolatların tamamında, ampisilin/sulbaktam, amoksisilin/klavulanik asit, sefotetan, kloramfenikol, imipenem, meropenem, metronidazol, mezlosilin, piperasilin ve piperasilin/tazobaktam antibiyotiklerine duyarlı, ampisilin, sefoksitin, klindamisin, penisilin ve tetrasikline dirençli oldukları tespit edilmiştir. Sonuç olarak yürütülen araştırma ile neonatal buzağı ve kuzu ishal vakalarında toksijenik C. difficile varlığı ilk kez ülkemizde tespit edilmiş olup bölgemizdeki ishalli neonatal buzağı ve kuzularda görülen ishal vakalarında C. difficile'nin de dikkate alınması gerektiği ortaya konulmuştur.en_US
dc.description.abstractClostridium difficile (Bacillus difficile) was first isolated from baby gaita specimens in 1935 and was not thought to be pathogenic, but since 1978 it has been accepted as pathogen by proving to be caused by antibiotic-associated diarrhea and pseudomembranous colitis. In this study, it was aimed to detection C. difficile in diarrheal calves, lambs, goats and in chickens grown in the farm and toxigenic characterization of these isolates and investigation of PCR ribotyping and antimicrobial susceptibility by microbroth method on toxin producing isolates. In the scope of the study, a total of 200 gaita samples including in the neonatal period 50 calves, 50 lambs and 50 goat feces samples and 50 chicken cloacal swab samples in 2015 were examined. Clostridium difficile was isolated by 58 (29.0 %) of the gaita samples collected during the study. Clostridium difficile was detected as 35 (70.0 %) of the gaita samples taken from the calves, 15 (30.0 %) of the lamb samples, 7 (14.0 %) of the goat specimens and 1 (2.0 %) of the chicken stool specimens. Identification and toxin characterization revealed that 28 (48.2 %) isolates had toxigenic character. The PCR ribotypes of the 28 toxigenic isolates identified PCR ribotypes 078, 012 and 033. A total of 24 toxigenic strains were tested for antimicrobial susceptibility by microbial dilution method. isolates were found to be resistant to ampicillin, clindamycin, cefoxitin, penicillin and tetracycline, susceptible to ampicillin/sulbactam, amoxicillin/clavulanic acid, cefotetan, cefoxitin, chloramphenicol, imipenem, meropenem, metronidazole, mezlosiline, piperacillin and piperacillin/tazobactam antimicrobial agents. As a result of this research, toxigenic C. difficile presence in neonatal calf and lamb diarrhea cases was detected for the first time in our country and C. difficile should be taken into account in case of diarrhea in diarrheal neonatal calves and lambs.en_US
dc.identifier.endpage87en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.uri
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12587/15843
dc.identifier.yoktezid515338
dc.language.isotr
dc.publisherKırıkkale Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectMikrobiyolojien_US
dc.subjectMicrobiology ; Veteriner Hekimliğien_US
dc.subjectVeterinary Medicineen_US
dc.subjectFelsefi düşünceen_US
dc.subjectPhilosophical thought ; Plotinusen_US
dc.subjecten_US
dc.subjecten_US
dc.subjecten_US
dc.titleGenç çiftlik hayvanlarının ishal vakalarından, clostridium difficile'in izolasyonu, identifikasyonu ve antimikrobiyal duyarlılığının belirlenmesien_US
dc.title.alternativeIsolation, identification and antimicrobial susceptibility determination of clostridium difficile from cases of diarrhea in young farm animalsen_US
dc.typeDoctoral Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
515338.pdf
Boyut:
1.74 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam metin/fulltext
İndir

Koleksiyon

Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu