Dolaşan Tümör DNA’larının Belirlenmesi İçin Gözenekli Silika Kaplı Manyetik Çekirdek-Kabuk Nanoparçacıkların Hazırlanması ve Önderiştirme ve Sensör Uygulama Potansiyellerinin İncelenmesi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorTunalı, Doğan
dc.date.accessioned2025-01-21T16:11:48Z
dc.date.available2025-01-21T16:11:48Z
dc.date.issued2019
dc.departmentKırıkkale Üniversitesi
dc.description15.06.2019
dc.description.abstractGünümüzde kanser tanısında yaygın olarak kullanılan biyopsi yönteminin invazif, uzmanlık gerektiren, uzun süren ve tekrarlanması zor bir yöntem olması nedeniyle alternatif yöntemler araştırılmaktadır. Bu amaçla araştırılan tümör kaynaklı dolaşan hücresiz DNA?lar (ctDNA) kanserin erken teşhisinde ve prognozunda kullanılan önemli biyobelirteçlerdir. Kan, salya, idrar gibi çeşitli vücut sıvılarında bulunan bu DNA parçalarını tespit etmek büyük hacimlerdeki çok düşük konsantrasyonları nedeniyle oldukça zordur. Günümüze kadar ctDNA tayininde yaygın biçimde kullanılan gelecek nesil sekanslama (Next generation sequencing NGS), kantitatif Polimeraz Zincir Reaksiyonu (qPCR) ve dijital PCR gibi yöntemlerde analiz süresinin uzunluğu, yöntemin maliyetinin yüksek olması, sekanslamanın kısıtlı olması gibi bazı dezavantajları nedeniyle farklı biyosensör platformları araştırılmıştır. Yapılan literatür taramasının ışığında ctDNA tayininde projemizin özgün yanlarından birisi olarak ilk defa moleküler işaret ışıkları ve manyetik nanoparçacıklar birlikte kullanılarak düşük maliyetli, hızlı sonuç veren ve kullanımı kolay bir sistem geliştirilmesi amaçlanmıştır. Çalışma kapsamındaki gözenekli silika kaplı manyetik nanoparçacıklar kolay sentezlenebilen, düşük maliyetli ve yüzey modifikasyonlarına açık olmalarının yanısıra manyetik özellikleri nedeniyle ayırma saflaştırmayı kolaylaştırıp tekrar kullanılabilirliği arttırmaları nedeniyle tercih edilmişlerdir. Hedef ctDNA?lara özgü moleküler işaret ışıkları sahip oldukları yüksek seçicilik özellikleri ile tek baz polimorfizmini bile ayırt edebilmelerinin yanısıra özel yapıları sayesinde hibridizasyonun gerçekleşmesi durumunda floresan sinyal yayarak ctDNA tayinini kolay ve pratik kılarlar. Bu çalışmadaki hedef mutasyonlar ise PIK3CA gen bölgesinde bulunan ve pek çok kanserde tespit edilen nokta mutasyonlarına sahip olmaları nedeniyle seçilmişlerdir. Çalışmada sentezlenen silika kaplı manyetik nanoparçacıklara hedef ctDNA?lara (E542K ve E545K mutantları) özgü moleküler işaret ışıkları immobilize edilmiştir. İçerisinde hedef ctDNA, hedef ctDNA?lardan tek nükleotit farkı olan yaban (wild) tipleri ve rastgele sentezlenmiş farklı oligonükleotitlerin bulunduğu karışımda üretilecek olan nanomanyetik DNA sensörlerinin hibridizasyon koşulları optimize edilmiş ardından verim, duyarlılık ve özgüllükleri değerlendirilmiştir.
dc.identifier.endpage35
dc.identifier.startpage1
dc.identifier.trdizinid620864
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/620864
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12587/21570
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.publicationcategoryProje
dc.relation.tubitakinfo:eu-repo/grantAgreement/TUBITAK/KBAG/117Z839
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_20241229
dc.subjectTıbbi İnformatik
dc.subjectTıbbi Araştırmalar Deneysel
dc.subjectNanobilim ve Nanoteknoloji
dc.subjectOnkoloji
dc.titleDolaşan Tümör DNA’larının Belirlenmesi İçin Gözenekli Silika Kaplı Manyetik Çekirdek-Kabuk Nanoparçacıkların Hazırlanması ve Önderiştirme ve Sensör Uygulama Potansiyellerinin İncelenmesi
dc.typeProject

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu